More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3088 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3088  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
369 aa  712    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34080  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  80.87 
 
 
367 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3475  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.53 
 
 
385 aa  531  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3736  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  73.92 
 
 
381 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2907  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  76.57 
 
 
373 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.978058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3515  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  74.93 
 
 
370 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.315655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2351  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  70.05 
 
 
369 aa  500  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.304441  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18610  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.54 
 
 
385 aa  491  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08970  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  66.03 
 
 
382 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0297  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.64 
 
 
361 aa  444  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4040  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  69.23 
 
 
368 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3344  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.65 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.675292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4315  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  64.5 
 
 
362 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2748  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.38 
 
 
350 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8993  Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.75 
 
 
341 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06060  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.37 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1636  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.88 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.38 
 
 
357 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0299  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.1 
 
 
347 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2071  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.43 
 
 
350 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4388  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.45 
 
 
354 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5111  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.41 
 
 
384 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182331  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4921  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.12 
 
 
357 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4538  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.12 
 
 
357 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5048  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.64 
 
 
360 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4625  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.12 
 
 
357 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10824  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.53 
 
 
364 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.04 
 
 
369 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3575  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  58.79 
 
 
358 aa  364  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0501989  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0164  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.89 
 
 
381 aa  362  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0781323  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0155  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.29 
 
 
384 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0949  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.71 
 
 
369 aa  354  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6141  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.95 
 
 
359 aa  353  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7209  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.47 
 
 
386 aa  348  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0442513  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37870  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.71 
 
 
356 aa  346  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4757  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.95 
 
 
351 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.09 
 
 
346 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.99 
 
 
350 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.26 
 
 
350 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.55 
 
 
346 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.13 
 
 
340 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.14 
 
 
347 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.93 
 
 
340 aa  315  8e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.48 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.3 
 
 
348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.74 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.01 
 
 
348 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.26 
 
 
346 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.06 
 
 
345 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.11 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.24 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477896 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  47.01 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.26 
 
 
346 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.64 
 
 
336 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.4 
 
 
346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.06 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.43 
 
 
345 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.73 
 
 
345 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.43 
 
 
345 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.35 
 
 
350 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.35 
 
 
350 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.35 
 
 
345 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.74 
 
 
348 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.35 
 
 
345 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  47.35 
 
 
345 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.48 
 
 
341 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.87 
 
 
348 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.4 
 
 
339 aa  298  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
347 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
347 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.77 
 
 
346 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.93 
 
 
345 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.82 
 
 
345 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.65 
 
 
352 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.43 
 
 
347 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.65 
 
 
340 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.51 
 
 
363 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.51 
 
 
352 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
345 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.61 
 
 
349 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.56 
 
 
354 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.48 
 
 
351 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.72 
 
 
350 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.15 
 
 
369 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.46 
 
 
345 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.35 
 
 
345 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.16 
 
 
348 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.63 
 
 
345 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.63 
 
 
345 aa  292  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.63 
 
 
345 aa  292  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.63 
 
 
345 aa  292  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  46.63 
 
 
345 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.63 
 
 
345 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.63 
 
 
345 aa  292  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.87 
 
 
359 aa  292  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.33 
 
 
345 aa  292  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17811  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  37.94 
 
 
347 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1268  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.04 
 
 
333 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.642063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.02 
 
 
352 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.33 
 
 
345 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>