26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4908 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  92.56 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  93.64 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  46.49 
 
 		 138 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  39.6 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  36.63 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  32.63 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  32.69 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  28.3 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1739  hypothetical protein  33.67 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.611186 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1725  hypothetical protein  33.67 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6353  hypothetical protein  33.67 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5022  hypothetical protein  31.63 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2145  hypothetical protein  29.9 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1647  hypothetical protein  29.9 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.491774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1647  hypothetical protein  29.9 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2279  hypothetical protein  28.87 
 
 		 314 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.989649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1533  hypothetical protein  29.59 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.914411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2088  hypothetical protein  28.87 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1872  hypothetical protein  28.81 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  34.07 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  29.13 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  30.61 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5457  hypothetical protein  31.3 
 
 		 195 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  34.04 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>