17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4890 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  643    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  67.39 
 
 
322 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  68.63 
 
 
325 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  64.58 
 
 
327 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  63.55 
 
 
402 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  66.33 
 
 
311 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  60.56 
 
 
320 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  58.62 
 
 
343 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  63.14 
 
 
344 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  63.55 
 
 
308 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  52.84 
 
 
296 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  43.83 
 
 
314 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.93 
 
 
828 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  26.54 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  21.75 
 
 
918 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  21.5 
 
 
517 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  28.21 
 
 
517 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>