16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4884 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4884  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  100 
 
 		 110 aa  207  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2266  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  100 
 
 		 110 aa  207  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430798  normal  0.0483089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0129  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  58 
 
 		 540 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4283  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  30.23 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.1 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  38.71 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.21 
 
 		 170 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  34.55 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  36.21 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1604  NADH dehydrogenase subunit B  31.67 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.1 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  37.1 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  38.46 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1401  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  40.62 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0780  ech hydrogenase subunit C  32.81 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>