31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4611 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4611    100 
 
 		 387 bp  767    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1659    89.42 
 
 		 240 bp  238  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3989  IS3 family transposase  85.66 
 
 		 498 bp  218  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  85.6 
 
 		 858 bp  216  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7697    87.07 
 
 		 153 bp  141  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7468    86.3 
 
 		 153 bp  131  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1494  hypothetical protein  81.59 
 
 		 693 bp  131  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2715  IS3 family transposase  85.27 
 
 		 135 bp  105  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  84.91 
 
 		 798 bp  83.8  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  84.91 
 
 		 798 bp  83.8  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  84.91 
 
 		 798 bp  83.8  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  84.91 
 
 		 798 bp  83.8  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  87.93 
 
 		 705 bp  60  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  87.93 
 
 		 705 bp  60  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  87.93 
 
 		 918 bp  60  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  87.93 
 
 		 705 bp  60  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  87.93 
 
 		 918 bp  60  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2757    79.74 
 
 		 786 bp  58  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4343    83.75 
 
 		 816 bp  56  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  81.91 
 
 		 783 bp  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  81.91 
 
 		 783 bp  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2810  integrase  81.63 
 
 		 843 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51540  putative transposase  93.75 
 
 		 570 bp  48.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000532814  hitchhiker  0.0000365126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  100 
 
 		 843 bp  48.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 939 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  93.75 
 
 		 1869 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  84.75 
 
 		 474 bp  46.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  87.23 
 
 		 849 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  87.23 
 
 		 849 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4821  transposase  80 
 
 		 357 bp  46.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.188807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  87.23 
 
 		 819 bp  46.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>