12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1611 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1611  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  800    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  37.7 
 
 
378 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  36.1 
 
 
387 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0620  hypothetical protein  31.94 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.500852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3875  hypothetical protein  37.35 
 
 
367 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  37.23 
 
 
346 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4409  hypothetical protein  38.35 
 
 
401 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  28.08 
 
 
722 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0807  hypothetical protein  27.14 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.70353  hitchhiker  0.0000627115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0870  hypothetical protein  26.97 
 
 
345 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.341415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2985  hypothetical protein  23.98 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000470132  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001490  hypothetical protein  29.57 
 
 
394 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.325195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>