40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1583 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1583  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 		 106 aa  203  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1036  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  60.4 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0560094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0742  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.63 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.35 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2740  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.61 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.287866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2664  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.18 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1002  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.35 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.05 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1396  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.5 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.58 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01570  hypothetical protein  38.89 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0804  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.37 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.04 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  29.63 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1639  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.68 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.68 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4786  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  24.24 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  28.57 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5268  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  37.27 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.13 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  31.82 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  32.35 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.53 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148667  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.14 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  25.45 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.660845  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.29 
 
 		 124 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.44 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3659  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.07 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.57 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.84 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2850  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.96 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2762  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.73 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.73 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0554454  normal  0.387715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2485  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1288  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  34.21 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35450  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  34.02 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.975038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  43.14 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>