11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0238 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6567  hypothetical protein  45.71 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0542  hypothetical protein  43.38 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2747  zinc metalloproteinase Mpr protein  36.8 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3892  zinc metalloproteinase Mpr protein  36.72 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472555  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6488  hypothetical protein  40.58 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0345  zinc metalloproteinase Mpr protein  41.92 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.22412  normal  0.306363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1969  zinc metalloproteinase Mpr protein  40.49 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7399  zinc metalloproteinase Mpr protein  29.83 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02022  zinc metalloproteinase Mpr protein  26.2 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02021  zinc metalloproteinase Mpr protein  41.3 
 
 		 59 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.462142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>