41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2446 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  33.33 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  30.07 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  30.72 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  34.64 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  30.07 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  30.07 
 
 		 154 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  28.48 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  28.1 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  29.93 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  28.76 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  30.14 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  28.83 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  27.74 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  28.48 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  24.52 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  31.25 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  28.08 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  28.77 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  27.61 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  26.09 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  27.39 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  29.25 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  26.09 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  28.38 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  25.35 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  26.76 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  26.76 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  25.35 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  26.76 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  26.21 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  26.06 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  25.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  28.68 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  24.68 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  24.65 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  26.15 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  22.07 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  29.66 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  23.68 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  25 
 
 		 146 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>