24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5238 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5238  DoxX family protein  100 
 
 		 128 aa  239  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6636  DoxX family protein  50.82 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1676  DoxX family protein  49.59 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1995  DoxX family protein  50.41 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1368  DoxX family protein  49.54 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0759  hypothetical protein  54.46 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4770  DoxX family protein  37.19 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00635642  hitchhiker  0.000154094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  37.38 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4100  DoxX family protein  33.58 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2514  hypothetical protein  44.62 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  34.52 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3794  DoxX family protein  42.35 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  32.38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2972  DoxX  29.13 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  41.18 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1288  hypothetical protein  31.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0969  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00033255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1114  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000313145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1036  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.049642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0947  hypothetical protein  31.37 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1111  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.019453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0957  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  32.35 
 
 		 542 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0942  hypothetical protein  34.91 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.438842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>