More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3531 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 301 aa  597  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  74.09 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  71.33 
 
 		 301 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  69.02 
 
 		 301 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  68 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  68.33 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  66.89 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  65.44 
 
 		 304 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  65.2 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  47.1 
 
 		 329 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  48.21 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  44.63 
 
 		 336 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  47.81 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 		 339 aa  231  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  49.16 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  39.4 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  41.59 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  39.8 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  39.8 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  39.8 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  41.37 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  34.43 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  30.32 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  33.2 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  31.56 
 
 		 333 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  31.15 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  32.23 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  35.68 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  30.49 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  30.49 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  30.49 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  30.41 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  31.18 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  31 
 
 		 331 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  31.18 
 
 		 351 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  25.54 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  28.69 
 
 		 361 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  28.15 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  29.44 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  29.88 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  28.43 
 
 		 506 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  31.14 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  28.43 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  26.72 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2660  hypothetical protein  30.21 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0870271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  29.75 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2892  Anthranilate phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0158  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.0330567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>