16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3370 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  100 
 
 		 370 aa  703    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  43.6 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  47.72 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  46.92 
 
 		 387 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  44.61 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  44.27 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  45.76 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  50.14 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  42.86 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  44.92 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  44.6 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  36.62 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  35.06 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  25.9 
 
 		 409 aa  46.2  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  19.03 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  31.21 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>