37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2620 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2620  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4929  hypothetical protein  51.43 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2008  hypothetical protein  53.38 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1145  hypothetical protein  51.91 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2388  hypothetical protein  54.01 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.558847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1470  hypothetical protein  53.28 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2613  hypothetical protein  54.2 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2676  putative transmembrane protein  51.47 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1777  putative transmembrane protein  47.86 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0109085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  36.54 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0781  hypothetical protein  29.53 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000248599  hitchhiker  0.0000184506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  37.1 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  30.72 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  30.72 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  30.72 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  30.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1016  hypothetical protein  26.53 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0774  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.46119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  27.14 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  31.54 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1130  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0568  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0583  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1285  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137932  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  29.75 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  32.21 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  31.82 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  31.54 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  28.76 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  29.05 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  32.99 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1264  hypothetical protein  30.5 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>