More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0980 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0980  histidinol-phosphate phosphatase  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4004  histidinol-phosphate phosphatase  57.63 
 
 
264 aa  261  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0730713  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3749  histidinol-phosphate phosphatase  56.49 
 
 
268 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4044  histidinol-phosphate phosphatase  56.49 
 
 
268 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1450  inositol monophosphatase family protein  52.63 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0099  inositol monophosphatase  52.63 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110645  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2598  putative inositol monophosphatase family protein  51.21 
 
 
262 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3165  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  50.6 
 
 
263 aa  235  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2434  histidinol-phosphate phosphatase, putative  49.6 
 
 
254 aa  234  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1387  inositol monophosphatase  45.1 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31726  predicted protein  41.44 
 
 
283 aa  209  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11303  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2941  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  46.67 
 
 
260 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2697  histidinol-phosphate phosphatase  44.27 
 
 
263 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1769  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  43.31 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0758104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2557  histidinol-phosphate phosphatase, putative  45.73 
 
 
263 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1982  histidinol-phosphate phosphatase, putative  45.45 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.655024  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2717  histidinol-phosphate phosphatase, putative  42.59 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0198902  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3157  inositol monophosphatase family protein  45.3 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3642  histidinol-phosphate phosphatase  41.73 
 
 
267 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000362348  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2774  putative inositol-1-monophosphatase  45.53 
 
 
273 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2889  histidinol-phosphate phosphatase  45.3 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796941  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3622  histidinol-phosphate phosphatase  43.31 
 
 
257 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511822  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4517  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  41.41 
 
 
260 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.158706  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3323  histidinol-phosphate phosphatase  42.91 
 
 
257 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0645  inositol monophosphatase  46.58 
 
 
256 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  41.7 
 
 
260 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4358  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  41.41 
 
 
260 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0029628  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  43.32 
 
 
257 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0541  inositol monophosphatase  49.32 
 
 
266 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2956  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  44.72 
 
 
259 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2504  histidinol-phosphate phosphatase, putative  45.95 
 
 
265 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7657  inositol monophosphatase  44.31 
 
 
274 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1893  inositol monophosphatase family protein  48.87 
 
 
266 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6965  inositol monophosphatase  45.3 
 
 
264 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751878  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0779  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  41.86 
 
 
261 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.441761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0975  inositol monophosphatase  46.19 
 
 
259 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5019  histidinol-phosphate phosphatase  40.84 
 
 
263 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.317763  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4559  histidinol-phosphate phosphatase  40.84 
 
 
263 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0522743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  43.2 
 
 
261 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2139  histidinol-phosphate phosphatase  44 
 
 
262 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.261779  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  40.23 
 
 
275 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1522  inositol monophosphatase  45.02 
 
 
278 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6307  inositol monophosphatase  45.02 
 
 
278 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2147  inositol monophosphatase  41.5 
 
 
268 aa  185  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5476  histidinol-phosphate phosphatase, putative  43.3 
 
 
224 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1233  inositol monophosphatase  44.09 
 
 
265 aa  185  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2950  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  40.86 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0099  inositol monophosphatase  42.74 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.151239  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0676  inositol monophosphatase  46.44 
 
 
266 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2818  histidinol-phosphate phosphatase, putative  40.46 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130997  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5075  histidinol-phosphate phosphatase  41.18 
 
 
263 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1683  Inositol-phosphate phosphatase  39.57 
 
 
264 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.510755  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4914  inositol monophosphatase  38.96 
 
 
269 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2748  histidinol-phosphate phosphatase, putative  41 
 
 
259 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0337561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3252  histidinol-phosphate phosphatase  38.26 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.714931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1907  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  40.17 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  41.46 
 
 
260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  41.8 
 
 
258 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0980  inositol monophosphatase  43.64 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  41.39 
 
 
258 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  40.75 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0280  histidinol-phosphate phosphatase  42.13 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2480  histidinol-phosphate phosphatase  39.25 
 
 
265 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  44.66 
 
 
278 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  36.6 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2586  Inositol-phosphate phosphatase  37.92 
 
 
260 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1791  histidinol-phosphate phosphatase  37.02 
 
 
270 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0647  Inositol-phosphate phosphatase  37.6 
 
 
255 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1726  histidinol-phosphate phosphatase  39.31 
 
 
262 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1217  inositol monophosphatase  37.55 
 
 
256 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.413525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0412  histidinol-phosphate phosphatase  39.39 
 
 
262 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1497  inositol monophosphatase  35.5 
 
 
269 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1470  inositol monophosphatase  35.5 
 
 
269 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4319  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.86 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.273658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0430  inositol monophosphatase  37.21 
 
 
274 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2248  inositol monophosphatase  35.04 
 
 
259 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.24134 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1542  histidinol-phosphate phosphatase  37.61 
 
 
253 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.06 
 
 
257 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1430  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  37.22 
 
 
255 aa  142  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3700  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.62 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000574664  normal  0.0324911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1799  histidinol-phosphate phosphatase  36.16 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0948  histidinol-phosphate phosphatase  33.93 
 
 
256 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0542  histidinol-phosphate phosphatase  35.41 
 
 
268 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8330  histidinol-phosphate phosphatase  35.41 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2305  inositol monophosphatase  34.85 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.209842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0929  histidinol-phosphate phosphatase  35.12 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.419149  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1522  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  34.98 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1396  histidinol-phosphate phosphatase  36.48 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.305327  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4101  histidinol-phosphate phosphatase, putative  37.02 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2496  histidinol-phosphate phosphatase  35.71 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05970  histidinol-phosphate phosphatase  34.38 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0890  histidinol-phosphate phosphatase  33.63 
 
 
259 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3720  histidinol-phosphate phosphatase, putative  35.42 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3789  histidinol-phosphate phosphatase  34.1 
 
 
279 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4200  histidinol-phosphate phosphatase  35.65 
 
 
268 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2655  histidinol-phosphate phosphatase  33.9 
 
 
270 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0892924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6379  histidinol-phosphate phosphatase  37.07 
 
 
280 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1697  histidinol-phosphate phosphatase  34.08 
 
 
291 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19490  histidinol-phosphate phosphatase  35.21 
 
 
264 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3773  histidinol-phosphate phosphatase  35.94 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0738114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>