34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0534 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26560  hypothetical protein  33.16 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3782  hypothetical protein  32.4 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2441  hypothetical protein  29.72 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.710457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0026  hypothetical protein  27.83 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.913081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4189  hypothetical protein  26.59 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2869  hypothetical protein  26.94 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0255  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0346  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0909  hypothetical protein  29.13 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1898  hypothetical protein  29.13 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2171  hypothetical protein  29.13 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1196  hypothetical protein  29.13 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1706  hypothetical protein  29.13 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0205  hypothetical protein  25.99 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3555  hypothetical protein  31.55 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3426  hypothetical protein  31.55 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2955  hypothetical protein  31.55 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0833098 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1890  hypothetical protein  30.81 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2006  hypothetical protein  30.81 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1032  hypothetical protein  30.81 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0449  hypothetical protein  30.81 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0737  hypothetical protein  30.81 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2085  hypothetical protein  30.27 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0712  hypothetical protein  29.73 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0800  hypothetical protein  29.73 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0735  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1683  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0544  hypothetical protein  26.02 
 
 		 256 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0860  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00330008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2133  hypothetical protein  26.02 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0725  hypothetical protein  26.02 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0614  hypothetical protein  26.02 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.705546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2035  hypothetical protein  26.02 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>