48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1646 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 		 118 aa  243  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  90.91 
 
 		 110 aa  208  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31970  hypothetical protein  54.37 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0270  hypothetical protein  50.49 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840372  normal  0.26913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1199  hypothetical protein  45.63 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3683  hypothetical protein  50.51 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1913  hypothetical protein  42.31 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0484  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  47.31 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1021  hypothetical protein  39.45 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1992  hypothetical protein  41.9 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48840  hypothetical protein  45.28 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0181  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0316  hypothetical protein  43.43 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0069  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.138923  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2834  hypothetical protein  53.09 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1851  hypothetical protein  53.92 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00587852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5659  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.748876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4244  hypothetical protein  40.59 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  41.75 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4414  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5215  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  39.45 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3171  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.63 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4126  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  43.88 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  41.49 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0140  hypothetical protein  38.78 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.765789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02180  RelE-like Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  39.36 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0293585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  35.45 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1954  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  48.91 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3210  hypothetical protein  35.9 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2231  hypothetical protein  45.12 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31040  hypothetical protein  39.77 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  45.59 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  38.75 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1903  hypothetical protein  36.9 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0652  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.5 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3672  hypothetical protein  32.65 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243113  normal  0.808254 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1116  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1573  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  34.31 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233615  normal  0.0445761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1852  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  34.31 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5138  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.97 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517981  normal  0.0200659 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1294  hypothetical protein  42.5 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.886265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  40.23 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.425253  normal  0.20556 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  31.87 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0925  hypothetical protein  32.14 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000524962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1506  hypothetical protein  42.19 
 
 		 112 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>