20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06896 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06896  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000898  hypothetical protein  83.14 
 
 		 255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003676  hypothetical protein  48 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003711  hypothetical protein  34.66 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0805647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02091  hypothetical protein  33.86 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0535  XRE family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4499  XRE family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0307  helix-turn-helix domain-containing protein  24.46 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0454  XRE family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.154754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1901  XRE family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5081  helix-turn-helix domain protein  21.58 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3879  XRE family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.478998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3152  helix-turn-helix domain protein  23.02 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.769189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4061  helix-turn-helix domain-containing protein  21.18 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.859423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1857  XRE family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3062  helix-turn-helix domain-containing protein  22.92 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3343  helix-turn-helix domain-containing protein  20.59 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4174  XRE family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.383217  normal  0.0580718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3581  XRE family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.367106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4193  XRE family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>