214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06309 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06309  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  282  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001426  hypothetical protein  73.28 
 
 
133 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00259614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1514  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.01 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4408  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.09 
 
 
135 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0150  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.21 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0878  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37.4 
 
 
134 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0334  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  40.32 
 
 
134 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7106  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.2 
 
 
125 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221304 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5412  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  40.34 
 
 
125 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.24 
 
 
149 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5167  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.04 
 
 
129 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.578961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4168  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.09 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  29.92 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2041  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.78 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000392642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.88 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.04 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  27.97 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0403  hypothetical protein  31.97 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  29.66 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0707  hypothetical protein  30.71 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  29.91 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.66 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.36 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.43 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1659  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.06 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0500  hypothetical protein  27.73 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  24.39 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0661  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.73 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1511  hypothetical protein  31.5 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.401586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.57 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.3 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  30.89 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.81 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.03 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05940  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03180)  33.33 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.81 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2092  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.56 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0175411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.21 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0451  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.05 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2171  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.35 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28950  hypothetical protein  29.06 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.906248  hitchhiker  0.0000303722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1928  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.15 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0516617  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1655  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.21 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.23 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267657  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0067  hypothetical protein  33.61 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610268  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.43 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2632  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.12 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3022  hypothetical protein  32.79 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3057  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.58 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10368  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11530)  25 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0141752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.19 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1277  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.12 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.71 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0424  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.27 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155822  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3816  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.21 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496132  normal  0.533485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.33 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  26.27 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4979  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0497  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.27 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.83 
 
 
158 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6234  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.4 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0691  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.25 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.979336  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0877  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3089  hypothetical protein  27.35 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.37 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2610  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.89 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4350  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.33 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.300431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2817  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.5 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  29.84 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2783  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.7 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0569406  hitchhiker  0.000528708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3911  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.35 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3921  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.63 
 
 
175 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5956  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.36 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.735238  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2237  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.66 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1327  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.5 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4010  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.21 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0522  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.12 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.288111  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.2 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.21 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0854  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.77 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1980  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.4 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2040  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.62 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.23 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.35 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4052  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.35 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0715  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.89 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1446  hypothetical protein  25.86 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2104  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0189  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.59 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2597  hypothetical protein  25.86 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4864  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.21 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2637  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.75 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.302583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1360  hypothetical protein  25.86 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1236  hypothetical protein  25.86 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0205  hypothetical protein  25.86 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0478  hypothetical protein  25.86 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0528952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1094  hypothetical protein  25.86 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.06 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4770  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.1 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251226  normal  0.268537 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07594  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15290)  28 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>