21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003518 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003518  type IIA topoisomerase B subunit  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000017095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02242  hypothetical protein  95.61 
 
 		 114 aa  220  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1143  hypothetical protein  82.46 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00345292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1386  hypothetical protein  64.22 
 
 		 111 aa  153  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0266268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2062  hypothetical protein  39.29 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2891  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2222  hypothetical protein  38.39 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163022  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1637  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681194  normal  0.0365332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1562  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2475  hypothetical protein  40.18 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0013472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1958  hypothetical protein  38.74 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1629  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.192073  normal  0.122976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1705  hypothetical protein  36.94 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2274  hypothetical protein  37.84 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1766  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.045673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1810  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586004  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2512  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1773  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1652  hypothetical protein  37.72 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.582788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2604  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0632  hypothetical protein  35.14 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>