233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001604 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  100 
 
 		 317 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  96.5 
 
 		 317 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  48.02 
 
 		 334 aa  321  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  38.05 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  37.19 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  37.19 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  35.42 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  34.19 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  35.42 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  33.55 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  33.97 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  35.11 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  35.35 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  38.19 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 408 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  32.79 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  37.66 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  32.63 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  31.13 
 
 		 506 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  28.76 
 
 		 491 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  26.56 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  26.56 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  26.56 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.94 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1694  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.45 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1980  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10650  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.45 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14230  predicted protein  24.17 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105496  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28937  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.17 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0103177  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0358  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.11 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.150136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.71 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.72 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.23 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3065  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.09 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2660  hypothetical protein  24.8 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0870271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  25.1 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.99 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1045  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.26 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000045527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>