33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0457 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0457  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.174165  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  91.04 
 
 
83 bp  77.8  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  93.48 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  95.24 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.80579 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0279286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  96.43 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  91.18 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  91.18 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>