12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2796 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2796  Thymidylate kinase-like protein  100 
 
 
603 aa  1215    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4615  thymidylate kinase  32.7 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3825  thymidylate kinase-like  28.17 
 
 
228 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.311883  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3961  thymidylate kinase  30.85 
 
 
237 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057611  normal  0.564595 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  24.48 
 
 
212 aa  48.9  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3581  thymidylate kinase  30.87 
 
 
236 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  24.55 
 
 
217 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5092  thymidylate kinase-like  23.53 
 
 
230 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  26.79 
 
 
216 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  26.71 
 
 
411 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  22.95 
 
 
219 aa  44.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1005  dTMP kinase  28.82 
 
 
226 aa  44.3  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>