20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1795 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1795  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1832  radical SAM domain-containing protein  96.51 
 
 
235 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0246453  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1582  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 
256 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1664  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 
254 aa  118  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1824  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 
261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1610  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
254 aa  114  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0456  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
351 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  27.74 
 
 
514 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
514 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
514 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 
299 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 
414 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 
351 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.23 
 
 
341 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0516  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.4 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0252566  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.01 
 
 
322 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.36 
 
 
333 aa  41.6  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>