16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1378 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  266  5e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  41.41 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  40.4 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0899  PilT domain-containing protein  37.29 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  36.23 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  39.6 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2777  PilT protein domain protein  33.06 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.293295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2206  PilT protein domain protein  33.06 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364897  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  35.48 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  53.66 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  38.57 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  47.73 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>