12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0998 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0998  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0594708  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0596  DNA polymerase beta domain protein region  29.53 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0115055  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  37.67 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  28.17 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0883  DNA polymerase beta subunit  29.55 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  36.07 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.74 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  24.77 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  45.45 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  48.98 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  36.21 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>