22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0124 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0124  CopG family transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.647828  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1284  CopG family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1834  CopG family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000112819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2084  CopG family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.140571 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1012  CopG family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.632842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1305  CopG family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.145448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2956  nickel responsive regulator  26.09 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0649578  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2005  CopG family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1320  nickel responsive regulator  26.32 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541993 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1594  CopG family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.334821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3039  nickel responsive regulator  26.42 
 
 		 139 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0411  CopG family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.629331  normal  0.0285278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0488  CopG family transcriptional regulator  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.632627  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7612  nickel responsive regulator  31.25 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1765  nickel responsive regulator  25.42 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1563  CopG family transcriptional regulator  25 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0193  CopG family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.272405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2250  CopG family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000647292  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1718  transcriptional regulator NikR, CopG family  23.53 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0162  CopG family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2765  nickel responsive regulator  27.03 
 
 		 139 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.648121  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1344  putative transcriptional regulator, CopG family  27.19 
 
 		 147 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>