More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4271 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4271  cell division FtsK/SpoIIIE  100 
 
 
577 aa  1142    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  22.15 
 
 
928 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.19 
 
 
850 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.29 
 
 
1174 aa  64.3  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.49 
 
 
1202 aa  63.9  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  22.61 
 
 
911 aa  63.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  25.24 
 
 
794 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  22.68 
 
 
913 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.48 
 
 
1157 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  25.24 
 
 
794 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0620  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.68 
 
 
1056 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000070904  normal  0.339115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.89 
 
 
1145 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.42 
 
 
849 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  22.36 
 
 
914 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  27.56 
 
 
1363 aa  62  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  22.36 
 
 
917 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0263  DNA translocase FtsK  27 
 
 
787 aa  61.6  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0538344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  24.28 
 
 
837 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  23.48 
 
 
1342 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.48 
 
 
1329 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  23.48 
 
 
1368 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  23.48 
 
 
1342 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.46 
 
 
917 aa  61.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  23.48 
 
 
1342 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  23.48 
 
 
1369 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  23.48 
 
 
1310 aa  61.2  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  24.12 
 
 
1187 aa  60.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1203  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.21 
 
 
935 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144076  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  23.48 
 
 
1329 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  23.48 
 
 
1329 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  22.91 
 
 
1091 aa  60.8  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0430  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.05 
 
 
1067 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4199  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.84 
 
 
894 aa  60.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0219443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.03 
 
 
841 aa  60.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.73 
 
 
895 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.672638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  23.68 
 
 
1244 aa  59.7  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  29.96 
 
 
1346 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1186  DNA translocase FtsK  25.45 
 
 
903 aa  60.1  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00816417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1393  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.39 
 
 
821 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.581217 
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  25.76 
 
 
959 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0389  DNA translocase FtsK  22.43 
 
 
1068 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0445802  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0412  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.29 
 
 
1604 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.62711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1351  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.39 
 
 
817 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  23.08 
 
 
1321 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1598  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.27 
 
 
734 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1205  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.69 
 
 
815 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00776005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2606  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.55 
 
 
1438 aa  58.9  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0797  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.93 
 
 
669 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3131  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.55 
 
 
779 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000468057  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.11 
 
 
908 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1074  DNA translocase FtsK  23.08 
 
 
1358 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.282682  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  23.08 
 
 
1379 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  23.08 
 
 
1360 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.11 
 
 
908 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  31.53 
 
 
1399 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0965  DNA translocase FtsK  23.08 
 
 
1360 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.7 
 
 
1446 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  23.75 
 
 
844 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.26 
 
 
896 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.26 
 
 
917 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.26 
 
 
917 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.26 
 
 
917 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.63 
 
 
727 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  30.08 
 
 
809 aa  58.2  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0660  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE related protein  26.98 
 
 
788 aa  58.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.437919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.26 
 
 
917 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3542  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.1 
 
 
954 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.217042  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.7 
 
 
716 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.27 
 
 
742 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0282565  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.67 
 
 
1310 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.02 
 
 
932 aa  57.4  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.3 
 
 
890 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0692  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.61 
 
 
784 aa  57.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  22.67 
 
 
1299 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.14 
 
 
726 aa  57.4  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  22.87 
 
 
884 aa  57.4  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  22.67 
 
 
1310 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  22.16 
 
 
879 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1396  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.55 
 
 
837 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.840983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  25.54 
 
 
1123 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0320  DNA translocase ftsK  22.42 
 
 
666 aa  56.6  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.437636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  21.5 
 
 
837 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  24.03 
 
 
1014 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0173  FtsK/SpoIIIE family protein  26.34 
 
 
846 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.857574  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1529  FtsK/SpoIIIE family protein  25.68 
 
 
816 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  25.22 
 
 
1107 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1463  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.15 
 
 
809 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1072  cell division FtsK/SpoIIIE  25.12 
 
 
774 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.272845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2740  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.98 
 
 
737 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.846429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.88 
 
 
881 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2352  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.62 
 
 
750 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000570174  decreased coverage  0.00265785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1771  cell division FtsK/SpoIIIE  25.83 
 
 
894 aa  56.2  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  21.81 
 
 
821 aa  55.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.88 
 
 
888 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.85 
 
 
902 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1302  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.16 
 
 
747 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.193601  normal  0.183958 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1154  DNA segregation ATPase FtsK  25.96 
 
 
787 aa  55.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.41 
 
 
1135 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1370  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.5 
 
 
831 aa  55.1  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.56 
 
 
951 aa  55.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>