More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3542 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1024  FtsK/SpoIIIE family protein  64.62 
 
 
899 aa  651    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10480  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  67.85 
 
 
992 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.77796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1093  cell division FtsK/SpoIIIE  73.31 
 
 
840 aa  720    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.902817  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25200  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  53.76 
 
 
785 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1234  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.61 
 
 
892 aa  780    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.228666  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9390  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  69.2 
 
 
811 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2193  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.43 
 
 
1015 aa  673    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12761  cell division transmembrane protein ftsK  69.67 
 
 
883 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.165349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.18 
 
 
918 aa  736    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.231031  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1771  cell division FtsK/SpoIIIE  48.98 
 
 
894 aa  768    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0793  ATPase  74.7 
 
 
833 aa  744    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.948463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2461  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.69 
 
 
836 aa  686    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3940  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.84 
 
 
842 aa  738    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4269  cell division FtsK/SpoIIIE  75.41 
 
 
762 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1534  cell division FtsK/SpoIIIE  71.95 
 
 
870 aa  694    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.706356  normal  0.937777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1456  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.67 
 
 
962 aa  763    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000268755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1351  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.23 
 
 
817 aa  748    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3542  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
954 aa  1860    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.217042  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2108  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.76 
 
 
870 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.984491  normal  0.12565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23270  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  55.66 
 
 
885 aa  810    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.980529  normal  0.0441248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7855  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.67 
 
 
879 aa  815    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.628926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2171  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  72.64 
 
 
838 aa  729    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372539  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07170  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  71.4 
 
 
1050 aa  693    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.712631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2121  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.76 
 
 
870 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.44 
 
 
881 aa  862    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.07008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1482  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.72 
 
 
851 aa  714    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0176325  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18080  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  65.46 
 
 
1046 aa  706    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181146  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1393  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.82 
 
 
821 aa  745    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.581217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0648  cell division protein FtsK/SpoIIIE  73.44 
 
 
838 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.104067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1454  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.24 
 
 
979 aa  767    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1203  cell divisionFtsK/SpoIIIE  93.11 
 
 
935 aa  938    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.144076  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1501  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.9 
 
 
820 aa  726    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019287  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2167  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.76 
 
 
870 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264766  normal  0.220358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2317  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.33 
 
 
878 aa  792    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1934  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.72 
 
 
760 aa  479  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.429485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2445  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.9 
 
 
793 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000220657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1406  DNA translocase FtsK  50.62 
 
 
793 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000239952  hitchhiker  0.000000381698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3893  stage III sporulation protein E  50.62 
 
 
793 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0045654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3131  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.51 
 
 
779 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000468057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.72 
 
 
727 aa  465  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3828  stage III sporulation protein E  50.42 
 
 
793 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000134118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3564  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.62 
 
 
794 aa  466  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000378493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3645  stage III sporulation protein E  50.42 
 
 
793 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00104928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3535  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  50.42 
 
 
793 aa  465  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000424384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3553  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  50.42 
 
 
793 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3930  stage III sporulation protein E  50.42 
 
 
793 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000252394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3842  stage III sporulation protein E  50.42 
 
 
793 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000180384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1463  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.04 
 
 
809 aa  466  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1631  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.14 
 
 
708 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000209197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1095  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.79 
 
 
808 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3806  stage III sporulation protein E  50.42 
 
 
793 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98433e-27 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.55 
 
 
742 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0282565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1072  cell division FtsK/SpoIIIE  37.92 
 
 
774 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.272845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0980  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.56 
 
 
728 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0601  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.57 
 
 
838 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0575901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08760  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.83 
 
 
758 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00860549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3114  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.47 
 
 
761 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1465  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.25 
 
 
822 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1944  cell division FtsK/SpoIIIE  52.2 
 
 
726 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3241  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.36 
 
 
902 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.120657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1930  DNA translocase FtsK  49.45 
 
 
796 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1648  DNA translocase FtsK  49.45 
 
 
796 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2954  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.65 
 
 
874 aa  446  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1344  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE related protein  49.69 
 
 
808 aa  444  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2740  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.77 
 
 
737 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.846429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.67 
 
 
776 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3039  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.43 
 
 
830 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.714384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4832  FtsK/SpoIIIE family protein  47.89 
 
 
1266 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0790517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  47.89 
 
 
1338 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4823  ftsk/spoiiie family protein  47.57 
 
 
1270 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1174  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.99 
 
 
766 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000151723  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0648  cell division FtsK/SpoIIIE  51.64 
 
 
724 aa  432  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4807  ftsk/spoiiie family protein  47.57 
 
 
1284 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10670  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  47.4 
 
 
1011 aa  432  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0694144  unclonable  0.0000000049543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0692  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.88 
 
 
784 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  47.89 
 
 
1311 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4440  cell division protein  47.57 
 
 
1266 aa  429  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4801  ftsk/spoiiie family protein  49.02 
 
 
1359 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0440152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  47.89 
 
 
1311 aa  429  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1265  DNA translocase FtsK  48.58 
 
 
740 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1598  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.74 
 
 
734 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.14 
 
 
1393 aa  426  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1529  FtsK/SpoIIIE family protein  47.85 
 
 
816 aa  426  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2757  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.43 
 
 
946 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000357113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0435  ftsk/spoiiie family protein  48.36 
 
 
1356 aa  426  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.099087  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3351  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47 
 
 
1035 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.08 
 
 
716 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07530  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  43.16 
 
 
815 aa  419  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00736792  normal  0.793851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1421  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.69 
 
 
736 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.655799  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1821  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE related protein  46.44 
 
 
755 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1757  DNA translocase FtsK  46 
 
 
831 aa  416  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1381  cell division protein  47.83 
 
 
804 aa  416  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1624  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.51 
 
 
842 aa  416  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000457082  hitchhiker  0.00000117661 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0843  FtsK/SpoIIIE family protein  33.66 
 
 
797 aa  411  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.29 
 
 
776 aa  412  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.8 
 
 
789 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1362  cell division protein FtsK/SpoIIIE  45.04 
 
 
788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.174513  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0195  cell division FtsK/SpoIIIE  40.07 
 
 
1199 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0835141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.04 
 
 
788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599515  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0786  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.27 
 
 
830 aa  405  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0101179  normal  0.147474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>