39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1196 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  67.06 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  66.29 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  66.29 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  66.29 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  73.65 
 
 		 175 aa  228  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  70.95 
 
 		 186 aa  220  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  67.46 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  61.27 
 
 		 179 aa  205  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  63.23 
 
 		 172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  56.55 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  54.97 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  55.41 
 
 		 321 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  55.33 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  55.17 
 
 		 267 aa  137  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  48.67 
 
 		 257 aa  137  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  53.62 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  42.7 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  45.73 
 
 		 328 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  48.97 
 
 		 295 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  50.33 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  42.25 
 
 		 195 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  46.36 
 
 		 300 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  44.76 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  43.38 
 
 		 340 aa  121  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  55.15 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  46.01 
 
 		 226 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  47.48 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  46.1 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  43.29 
 
 		 194 aa  103  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  45.33 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  42.03 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  35.26 
 
 		 258 aa  85.5  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  39.76 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  43.48 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  39.29 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  40.82 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  35.1 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  31.43 
 
 		 257 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>