23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0317 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0317  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3628  transcriptional regulator, ArsR family  28.47 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0982229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  28.4 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3838  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000189595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1135  hypothetical protein  25.37 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.22269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12850  hypothetical protein  23.68 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.822848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8892  hypothetical protein  27.91 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2204  hypothetical protein  31.08 
 
 		 171 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000962337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  31.67 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  30.16 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  31.67 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 132 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 102 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 120 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 137 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 102 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>