30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3515 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3515  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  57.89 
 
 
54 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1687  hypothetical protein  60 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579492  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  43.64 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1508  hypothetical protein  58.54 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.265609  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  42.31 
 
 
60 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1485  hypothetical protein  47.17 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1795  putative hemin uptake protein  51.35 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311499  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0864  hypothetical protein  56.76 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0882305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1930  hypothetical protein  45.83 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1909  hypothetical protein  47.17 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1926  hypothetical protein  47.17 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2571  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0219978  hitchhiker  0.000328028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1117  hypothetical protein  44.23 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.180887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2423  hypothetical protein  45.28 
 
 
72 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01663  hypothetical protein  45.28 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0935072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1937  conserved hypothetical protein  45.28 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1923  hypothetical protein  45.28 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.167595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1785  hypothetical protein  45.28 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01674  hypothetical protein  45.28 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.151752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2119  putative hemin uptake protein  48.65 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.241554  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  44.44 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.179032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  55.56 
 
 
62 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0778  hypothetical protein  46.94 
 
 
48 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2094  hypothetical protein  46.94 
 
 
48 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3132  hypothetical protein  62.86 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  45.65 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  46.51 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1567  Hemin uptake protein hemP  55.88 
 
 
44 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2280  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  normal  0.012647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>