21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2728 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  874    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  57.42 
 
 
455 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  56.97 
 
 
440 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  53.28 
 
 
424 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  54.72 
 
 
451 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  55.37 
 
 
557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  55.03 
 
 
377 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  53.35 
 
 
583 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  44.87 
 
 
429 aa  346  5e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  39.52 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  39.79 
 
 
381 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  28.42 
 
 
405 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  29.47 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  28.46 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  29.41 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  30.95 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  24.5 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  26.2 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  23.77 
 
 
454 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  25.5 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  39.78 
 
 
475 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>