19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2116 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2116  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1037    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.539609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  46.71 
 
 
1022 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  46.71 
 
 
853 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2303  hypothetical protein  40.48 
 
 
678 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2083  hypothetical protein  39.47 
 
 
615 aa  340  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.999521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00124  hypothetical protein  39.14 
 
 
622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  34.91 
 
 
664 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  34.91 
 
 
664 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  33.13 
 
 
759 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0313  hypothetical protein  34.35 
 
 
746 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1219  hypothetical protein  34.56 
 
 
693 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1399  hypothetical protein  37.38 
 
 
487 aa  203  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  32.5 
 
 
483 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  37.18 
 
 
268 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  30.53 
 
 
209 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  35.9 
 
 
284 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  27.74 
 
 
266 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  32.05 
 
 
289 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  29.68 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>