17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0678 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  49.73 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  42.95 
 
 
174 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  40.65 
 
 
188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  44.83 
 
 
170 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  41.96 
 
 
172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  42.66 
 
 
172 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  41.67 
 
 
184 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  32.75 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  29.08 
 
 
378 aa  59.3  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  26.59 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  30 
 
 
364 aa  58.9  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  33.09 
 
 
350 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  29.2 
 
 
232 aa  55.5  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  26.09 
 
 
918 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  30.65 
 
 
364 aa  49.3  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>