18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0208 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0208  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  209  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  44.25 
 
 
179 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  45.19 
 
 
172 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  33.65 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  36.84 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  38 
 
 
190 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  38.46 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  35.53 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  34.86 
 
 
118 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  34.86 
 
 
118 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  34.86 
 
 
118 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  34.86 
 
 
118 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  34.86 
 
 
118 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  39.39 
 
 
131 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  39.39 
 
 
131 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  34.86 
 
 
118 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  34.86 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  35.53 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>