25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0062 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0062  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0038  tRNA-Val  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.978426  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0042  tRNA-Val  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000949792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0046  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0044  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0701  tRNA-Val  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0037  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00626142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0898  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.542137  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0020  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000127781  normal  0.601367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>