More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1750 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1272  ABC transporter related  46.85 
 
 
224 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  43.86 
 
 
266 aa  187  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0726  ABC transporter related  43.3 
 
 
262 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.904446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  44 
 
 
287 aa  182  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
281 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  40.27 
 
 
288 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 
280 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.77 
 
 
292 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
285 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  39.46 
 
 
290 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.26 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.81 
 
 
286 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  37.27 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2289  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.04 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.04 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.34 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl153  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.77 
 
 
315 aa  161  8.000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  37.5 
 
 
283 aa  161  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  37.5 
 
 
283 aa  161  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1504  ABC transporter related  39.56 
 
 
268 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
288 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  39.91 
 
 
288 aa  158  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 
288 aa  158  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.2 
 
 
291 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
293 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  40.55 
 
 
574 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0667  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 
289 aa  157  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
293 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.62 
 
 
293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
293 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
293 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
293 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
293 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 
293 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.76 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2125  ABC transporter related  35.37 
 
 
272 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0679248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
293 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  36.09 
 
 
292 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  38.29 
 
 
282 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
286 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  36.61 
 
 
557 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 
293 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  37 
 
 
286 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 
293 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
255 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.62 
 
 
285 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  35.53 
 
 
289 aa  148  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0584  membrane associated ATPase  38.5 
 
 
278 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  35.68 
 
 
272 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1152  ABC transporter related protein  34.05 
 
 
279 aa  143  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00740539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  34.19 
 
 
283 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  35.93 
 
 
283 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  37.22 
 
 
287 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.07 
 
 
284 aa  142  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  34.07 
 
 
568 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  39.07 
 
 
282 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.39 
 
 
280 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  34.38 
 
 
501 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  35.15 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  37.12 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.72 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.74 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.93 
 
 
278 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.07 
 
 
310 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.93 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.93 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0624  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.75 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.458442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.93 
 
 
300 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.93 
 
 
300 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.11 
 
 
278 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  35.68 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.07 
 
 
568 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.48 
 
 
280 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.48 
 
 
280 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0668  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.81 
 
 
408 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.88 
 
 
280 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  33.33 
 
 
273 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.04 
 
 
280 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.03 
 
 
280 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  35 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  33.33 
 
 
497 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 
254 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  32.3 
 
 
254 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
482 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.27 
 
 
277 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.94 
 
 
256 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.04 
 
 
398 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  36.53 
 
 
501 aa  134  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  32.31 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0336  ABC transporter related  38.36 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0600592 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.18 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.98 
 
 
510 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.95 
 
 
305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.86 
 
 
277 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>