16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1343 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  61.08 
 
 
335 aa  430  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  53.36 
 
 
314 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  53.02 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  48.56 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  30.74 
 
 
302 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  30.18 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
285 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  27.63 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  26.3 
 
 
316 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  28.81 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  25.43 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  21.6 
 
 
332 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  22.16 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  22.17 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  20.82 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>