33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3006 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3006  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.761715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3043  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00029722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  49.23 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  60.71 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0331  hypothetical protein  53.7 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.544254  decreased coverage  0.009055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  42.42 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  42.42 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1640  hypothetical protein  42.65 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0343284  normal  0.981714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  36.23 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  42.03 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  42.03 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4386  putative transmembrane protein  44.93 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1466  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.478313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  35.82 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  41.27 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1685  hypothetical protein  37.68 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.386414  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1935  hypothetical protein  36.76 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.452225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0243  hypothetical protein  33.82 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0138719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  33.82 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.508917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0297  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1680  putative transmembrane protein  37.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6167  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.087743  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7067  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368637  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6561  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  42.65 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1270  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1384  putative transmembrane protein  36.23 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  32.84 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  32.84 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  32.84 
 
 		 69 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>