41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4386 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4386  putative transmembrane protein  100 
 
 		 73 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  65.75 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  63.01 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  60 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1384  putative transmembrane protein  57.53 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  58.57 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1685  hypothetical protein  52.05 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.386414  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6167  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.087743  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7067  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368637  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6561  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1270  hypothetical protein  51.43 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1680  putative transmembrane protein  46.25 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  45.71 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  44.29 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1935  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.452225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  41.1 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1640  hypothetical protein  44.44 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0343284  normal  0.981714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6171  hypothetical protein  42.47 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2841  hypothetical protein  42.47 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353606  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2852  hypothetical protein  42.47 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  38.36 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.508917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0266  hypothetical protein  42.03 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  41.1 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  41.1 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2758  hypothetical protein  42.47 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0462  hypothetical protein  41.1 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0808424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3192  hypothetical protein  39.73 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2855  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0513  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0495  hypothetical protein  39.73 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1428  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0164  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0431  hypothetical protein  39.73 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0678  hypothetical protein  39.73 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  44.12 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  44.12 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0319  transmembrane protein  38.89 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0243  hypothetical protein  36.99 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0138719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  39.73 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3824  hypothetical protein  62.16 
 
 		 37 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.620418 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  44.62 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>