19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1713 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1713  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1635  putative transmembrane anti-sigma factor  56.58 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  42.65 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  36.62 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  36.62 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  32.31 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  28.17 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  31.82 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1917  anti-sigma factor  38.24 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  32.84 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0549  anti-sigma factor  32.39 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4633  putative transmembrane anti-sigma factor  31.65 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  27.69 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0755  anti-sigma factor  33.33 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  36.73 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1213  Anti-sigma factor RshA  33.85 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2225  hypothetical protein  35.94 
 
 		 91 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2650  hypothetical protein  30 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  30.77 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>