27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1834 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  931    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  50.83 
 
 
474 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  38.16 
 
 
504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  28.69 
 
 
513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  26.94 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  22.6 
 
 
594 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  24.07 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.77 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  21.59 
 
 
576 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  24.15 
 
 
622 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1149  hypothetical protein  23.13 
 
 
447 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0538158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  21.27 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  22.67 
 
 
280 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.11 
 
 
307 aa  60.5  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1677  CRISPR-associated RAMP protein  24.59 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.71005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.18 
 
 
288 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  24.04 
 
 
237 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  20.93 
 
 
289 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  23.83 
 
 
274 aa  50.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1008  hypothetical protein  22.89 
 
 
808 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226186  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  25.36 
 
 
558 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  26.6 
 
 
299 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.83 
 
 
282 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  21.68 
 
 
267 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  24.63 
 
 
257 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  23.32 
 
 
254 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.43 
 
 
279 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>