20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4650 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4650  ribulose-5-phosphate 4-epimerase and related epimerase and aldolases  100 
 
 		 198 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4750  class II aldolase/adducin family protein  55.9 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1766  hypothetical protein  41.71 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1443  hypothetical protein  41.71 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4568  class II aldolase/adducin family protein  33.5 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0526  hypothetical protein  34.83 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0856  L-fuculose phosphate aldolase, putative  32.89 
 
 		 395 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.668343  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  26.11 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2035  class II aldolase/adducin family protein  24 
 
 		 368 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0002  class II aldolase/adducin family protein  24.43 
 
 		 391 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0529715  unclonable  0.0000097128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3879  class II aldolase/adducin family protein  23.73 
 
 		 391 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0500117 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  31.78 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.61 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3906  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.06 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.936688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1120  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.06 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3955  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.83 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.918987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4000  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.35 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.850049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3875  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.35 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3891  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.83 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4062  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.35 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.612579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>