58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3049 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  100 
 
 
143 aa  282  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  59.44 
 
 
145 aa  173  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  55.94 
 
 
145 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  50.69 
 
 
146 aa  140  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  50.69 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  48.97 
 
 
147 aa  136  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 
144 aa  133  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  46.85 
 
 
146 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 
145 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  48.61 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 
145 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  46.21 
 
 
147 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  43.45 
 
 
152 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  45.14 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  45.83 
 
 
153 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 
148 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  43.45 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  34.27 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  35.46 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 
146 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  38.41 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  30.99 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  34.51 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  30.5 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  29.13 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  26.57 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  21.01 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  25 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  25.42 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  22.12 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  22.12 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  22.12 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  30.14 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  23.24 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2353  hypothetical protein  26.61 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2345  hypothetical protein  26.61 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0639664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2306  hypothetical protein  26.61 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>