More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1110 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1110  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
264 aa  552  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.516455  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  26.45 
 
 
341 aa  95.5  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  26.22 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  29.47 
 
 
317 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  28.21 
 
 
341 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  26.69 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.62 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  25 
 
 
297 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.15 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  28.21 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  26.83 
 
 
313 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.21 
 
 
315 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  25.55 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.01 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  25.96 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  25 
 
 
315 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  28.2 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  27.46 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.31 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  25.28 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  27.87 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  25.18 
 
 
290 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  26.62 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  28.97 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  25.93 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1582  heat shock protein DnaJ, N-terminal  24.2 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.814201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  26.33 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.75 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  28.57 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  28.88 
 
 
306 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  28.88 
 
 
306 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  28.88 
 
 
306 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  28.88 
 
 
306 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  28.88 
 
 
306 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  28.63 
 
 
306 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  27.24 
 
 
306 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0778  co-chaperone-curved DNA binding protein A  24.72 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  29.63 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  24.92 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  28.47 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  28 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  27.37 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  29.09 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  54.05 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02921  DnaJ3 protein  23.49 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  28.24 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  25.88 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.05 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.05 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  23.28 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  25.76 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  25.76 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  25.76 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  25.76 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  28.73 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  25.76 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.17 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  54.93 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  23.11 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  28.26 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.42 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  54.93 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  25.84 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  25.38 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  24.91 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  26.41 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.15 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  26.04 
 
 
283 aa  72  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  27.86 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  52.31 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  24.91 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  58.93 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  40.43 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  62.26 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  62.26 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  58.49 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.24 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  23.74 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  25.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1280  DnaJ domain protein  47.22 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  24.13 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0379  chaperone protein DnaJ  52.63 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  26.16 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3455  chaperone protein DnaJ  55.36 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.94 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.94 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4692  chaperone protein DnaJ  51.79 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3835  chaperone protein DnaJ  55.36 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.504584  hitchhiker  0.000855612 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>