42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2629 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  753    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  39.1 
 
 		 705 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1182  hypothetical protein  28.53 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5112  hypothetical protein  40.37 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0966  hypothetical protein  49.18 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  44.83 
 
 		 122 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  44.83 
 
 		 122 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.51 
 
 		 1403 aa  53.5  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 1146 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  40 
 
 		 1421 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  38.3 
 
 		 123 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1188  hypothetical protein  40.98 
 
 		 124 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1037  protein of unknown function DUF559  42.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  43.33 
 
 		 849 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1522  hypothetical protein  32.11 
 
 		 142 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.576255  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7441  protein of unknown function DUF559  42.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0206411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4529  hypothetical protein  38.98 
 
 		 117 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4118  hypothetical protein  38.57 
 
 		 125 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000578053  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1229  hypothetical protein  39.68 
 
 		 159 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3620  protein of unknown function DUF559  36.99 
 
 		 142 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1681  protein of unknown function DUF559  39.34 
 
 		 117 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5447  protein of unknown function DUF559  36.07 
 
 		 137 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2534  hypothetical protein  37.14 
 
 		 114 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.984532  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2301  hypothetical protein  36.25 
 
 		 146 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  0.158552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0022  protein of unknown function DUF559  40.58 
 
 		 123 aa  46.6  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0546  hypothetical protein  39.34 
 
 		 123 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  0.680217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1238  protein of unknown function DUF559  31.43 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0433  hypothetical protein  39.34 
 
 		 132 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  32.05 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1220  hypothetical protein  31.43 
 
 		 144 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3456  hypothetical protein  38.67 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  34.62 
 
 		 925 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0029  hypothetical protein  41.51 
 
 		 128 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2722  hypothetical protein  36.49 
 
 		 147 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0673  hypothetical protein  28.21 
 
 		 173 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1037  hypothetical protein  39.06 
 
 		 120 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  37.5 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2473  protein of unknown function DUF559  37.5 
 
 		 121 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0405  hypothetical protein  36.23 
 
 		 131 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51690  hypothetical protein  38.57 
 
 		 120 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00189742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0647  hypothetical protein  36.23 
 
 		 138 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.177117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>