19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0715 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  302  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  56.06 
 
 
158 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  45.45 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  42.06 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  43.48 
 
 
259 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
421 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  42.99 
 
 
301 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
477 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.93 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  43.82 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  44.57 
 
 
1931 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  39.8 
 
 
333 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 
398 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2261  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000590527  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  24.83 
 
 
567 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
451 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
406 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.72 
 
 
416 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>