86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3062 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3062  metallophosphoesterase  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27593  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  34.17 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0270  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.407111  normal  0.0834706 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1254  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1385  metallophosphoesterase  35.9 
 
 
262 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.745562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2697  phosphoesterase related to the Icc protein-like protein  33.33 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1372  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
207 aa  72  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0682  metallophosphoesterase  31.38 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0388677  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0194  metallophosphoesterase  31.86 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3050  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
255 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24900  predicted phosphoesterase, ICC  29.88 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.45457  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1512  metallophosphoesterase  28.06 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000329408 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1145  hypothetical protein  29.44 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1331  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.174892  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0200  metallophosphoesterase  31.1 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1270  metallophosphoesterase  29.56 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.254283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0339  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0897854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1743  metallophosphoesterase  28.34 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.97747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3096  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
285 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2514  serine/threonine protein phosphatase family protein  30.39 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0932  metallophosphoesterase  28.16 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1744  hypothetical protein  25.56 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1168  metallophosphoesterase  27.86 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1287  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.11 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1325  metallophosphoesterase  28.67 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.597673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2142  metallophosphoesterase  29.29 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1871  metallophosphoesterase  28.93 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1203  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0815  metallophosphoesterase  27.4 
 
 
253 aa  55.5  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.983977  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00464  Ser/Thr protein phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04330)  36.9 
 
 
279 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.357833  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2617  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1324  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.763713  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3047  metallophosphoesterase  26.95 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0293  metallophosphoesterase  30.86 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1821  metallophosphoesterase  29.53 
 
 
296 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1723  metallophosphoesterase  25 
 
 
210 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0919  metallophosphoesterase  30 
 
 
208 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0649979 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0035  metallophosphoesterase  24.64 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.525214  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0984  metallophosphoesterase  26.09 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  33.1 
 
 
258 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3234  metallophosphoesterase  27.49 
 
 
265 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  hitchhiker  0.000107712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01360  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.28 
 
 
209 aa  48.5  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2256  metallophosphoesterase  29.65 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  hitchhiker  0.0021497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0832  metallophosphoesterase  26.28 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.83627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  35.51 
 
 
280 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  36.78 
 
 
262 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3968  metallophosphoesterase  29.76 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0695  metallophosphoesterase  25.73 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0227916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4012  hypothetical protein  23.12 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5569  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000501153  normal  0.028813 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0957  metallophosphoesterase  24.24 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.332804  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0537  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
283 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  32.71 
 
 
268 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0653  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
283 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0220  metallophosphoesterase, calcineurin superfamily, putative  23.56 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  33.98 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
275 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  30.2 
 
 
499 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3797  metallophosphoesterase  39.68 
 
 
278 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.842206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3014  metallophosphoesterase  28.05 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  29.87 
 
 
544 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
255 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0988  metallophosphoesterase  24.24 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.165399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  46.88 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.75 
 
 
327 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.75 
 
 
327 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.75 
 
 
331 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.75 
 
 
323 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.75 
 
 
327 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0772  hypothetical protein  38.6 
 
 
321 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0792  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.75 
 
 
327 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.75 
 
 
327 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2319  phosphoesterase, Icc protein-like protein  28.72 
 
 
225 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10532  Ser/Thr protein phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06000)  29.17 
 
 
385 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.846198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0876  phosphoesterase  29.13 
 
 
304 aa  41.6  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.788657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2617  metallophosphoesterase  32.48 
 
 
279 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0457152  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  38.81 
 
 
261 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>