22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1385 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1385  metallophosphoesterase  100 
 
 
262 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.745562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24900  predicted phosphoesterase, ICC  59.62 
 
 
265 aa  325  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.45457  normal  0.373005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2697  phosphoesterase related to the Icc protein-like protein  55.89 
 
 
261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3050  metallophosphoesterase  54.41 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000443349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3096  metallophosphoesterase  53.99 
 
 
285 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1821  metallophosphoesterase  52.09 
 
 
296 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3234  metallophosphoesterase  43.24 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  hitchhiker  0.000107712 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3062  metallophosphoesterase  35.9 
 
 
202 aa  79  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27593  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2799  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 
309 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.309872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1512  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
210 aa  52  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000329408 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2514  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.54 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2142  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1254  metallophosphoesterase  30.72 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0270  metallophosphoesterase  31.21 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.407111  normal  0.0834706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0653  metallophosphoesterase  27.9 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0194  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3968  metallophosphoesterase  30.91 
 
 
207 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0537  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0876  phosphoesterase  29.53 
 
 
304 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.788657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  24.15 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0984  metallophosphoesterase  23.48 
 
 
226 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1270  metallophosphoesterase  24.54 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.254283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>