45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1738 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1928  hypothetical protein  42.52 
 
 		 222 aa  151  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  39.61 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  38.36 
 
 		 433 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  33.76 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  27.35 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  25.22 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  31.55 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  24.07 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  27.32 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  24.65 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  25.36 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  26.37 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  23.53 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  27.05 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  26.82 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  23.33 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  25.79 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  25.68 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  26.17 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.21 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  26.09 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  23 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  20.56 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  26.32 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  24.88 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  26.32 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  26.32 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  25.93 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  19.8 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  26.28 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  30.82 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  25.22 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  23.5 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  29.38 
 
 		 218 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  19.44 
 
 		 220 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  25.79 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  25.79 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  25.79 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  25.79 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.3 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  20.85 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>